La parte principal del cerebro que afecta el trastorno bipolar es la corteza prefrontal. La corteza prefrontal es menor en las personas con trastorno bipolar, señala el Instituto Nacional de Salud Mental.Los neurotransmisores en el cerebro también juegan un papel en el trastorno bipolar. El principal contribuyente es la serotonina y esta sustancia química natural también puede ser responsable de otros trastornos del estado de ánimo, como la depresión. Las personas con parientes que sufren de trastorno bipolar son más propensos a tener esta enfermedad mental que las personas sin antecedentes familiares.